Flatbunnede plater kan brukes til alle celletyper, men når antallet celler er lite, for eksempel til kloning, brukes en 96-brønns plate.
I tillegg brukes flatbunnede plater generelt til MTT og andre eksperimenter, både for vegger og suspenderte celler.
U- eller V-plater brukes vanligvis for spesifikke krav.For eksempel, i immunologi, når to forskjellige lymfocytter blandes, må de være i kontakt med hverandre for stimulering.Derfor kreves vanligvis U-plater da cellene vil samle seg på et lite område på grunn av tyngdekraften.V-plater brukes mye sjeldnere for celledrapsforsøk for å bringe målcellene i nær kontakt, men de kan også erstattes av U-plater (etter tilsetning av celler, sentrifugering ved lav hastighet).
For cellekultur brukes vanligvis flatbunnede plater, med spesiell oppmerksomhet på materialet.
De rundbunnede brukes vanligvis til analyse, kjemiske reaksjoner eller prøvelagring.Dette er fordi den runde bunnen er bedre til å få væsken ren, i motsetning til den flate bunnen.Men hvis du måler absorbansverdier, bør du alltid kjøpe en flatbunnet.
De fleste cellekulturplater har flat bunn for enkel mikroskopisk observasjon, et klart bunnområde, et relativt jevnt cellekulturnivå og for MTT-testing.
Rundbunnede plater brukes hovedsakelig til isotop-dopingeksperimenter der celler må samles med en cellesamler, for eksempel "blandede lymfocyttkulturer".